《魔法少女小圆 剧场版》讲述的是在电视动画第一季的结尾找到了新的支配魔法少女的方式，“魔女的化身”也在最后实现了愿望，神浅草子消失之后，在等待救赎的同时，魔法少女飞鸟酱不停地解救贫穷的魔法少女。在第二季中，情节更加复杂，各个角色的命运也更令人担忧。而电影版则让“魔法少女小圆”的故事饱满地结束。
在魔法少女小圆剧场版中，“魔女”的概念被进一步延伸和体现。电视动画里七大魔女都是悲哀、凄惨的，但是在电影版中，各个魔女的故事却充满着亲情，友情不是简单的毁灭和悲惨结局。“魔法少女小圆剧场版”让人们看到了人性，善恶不是黑白分明的。
此外，“魔法少女小圆剧场版”的人设也是值得一说的。在电视动画中，魔法少女的符咒通常以类似英文的奇怪字母表示，但在电影版中不再是这样，而是全都变成了中文。这种决定的产生和《魔法少女小圆》的故事发展严密相关，也加深了人物内心的冲突。
由于《魔法少女小圆》的影响力，电影版上映后也受到了热烈的反响。
